Lien entre pathogènes, auto-immunité et carence en vitamine D

Les dernières recherches scientifiques sur l’auto-immunité, le microbiote (flore intestinale) et les pathogènes montrent que l’épidémie de carence en vitamine D ne serait pas la cause des soucis de santé mais plutôt l’une des conséquences des problèmes sous-jacents.
Le nombre de maladies auto-immunes ne cessent d’augmenter et cette recherche nous éloigne de la cause génétique.
J’ai pris le temps de vous traduire l’article car il me semble vraiment intéressant pour tous ceux qui souffrent de ces maladies.

Information sur l’auteur
Autoimmunity Research Foundation, Sunnyside, New York
bWeill Cornell Medical College, New York, USA
cMurdoch University, Murdoch, AustraliaLes

Objectif de l’examen: démontrer comment la dysbiose du microbiome humain peut conduire à une maladie auto-immune.

Des découvertes récentes:

Les humains sont des superorganismes. Le corps humain abrite un vaste microbiome, celui-ci diffère chez les patients ayant des diagnostics de maladies auto-immunes. Les microbes intracellulaires ralentissent les défenses immunitaires innées par un dérèglement du récepteur nucléaire de la vitamine D, ce qui permet aux agents pathogènes de s’accumuler dans les tissus et le sang. Le mimétisme moléculaire entre l’hôte et l’agent pathogène provoque un dysfonctionnement en interférant avec les interactions entre protéines humaines. Les auto-anticorps peuvent très bien être créé en réponse aux agents pathogènes.

Résumé:

La défaillance catastrophique du métabolisme humain observé dans les résultats de maladies auto-immunes résulte d’une pathogénie commune sous-jacente – l’accumulation successive d’agents pathogènes dans le microbiome au fil du temps, et la capacité de ces agents pathogènes à dérégler la transcription des gènes, la traduction et les processus métaboliques de l’homme. Les maladies auto-immunes sont plus susceptibles chez certaines familles à cause de l’héritage d’un microbiome familiale, plutôt que l’hérédité mendélienne des anomalies génétiques. Nous pouvons stimuler les défenses immunitaires innées et permettre aux patients de cibler ces pathogènes, mais les résultats de la mort cellulaire entraîne une immunopathologie.

INTRODUCTION

La théorie de l’auto-immunité, dans lequel le corps attaque le «soi», venu de l’âge où le corps humain était considéré comme largement stérile, jusqu’à récemment les microbes ne pouvaient être identifiées que par la culture. En l’absence d’une voie de pathogènes, une pathogénie auto-immune semble logique. Au cours de la dernière décennie, toutefois, les technologies informatiques de séquençage de l’ADN ont permis à des milliers de nouveaux génomes microbiens au sein de l’Homo sapiens d’être identifier. Cette révolution dans notre capacité à caractériser et étudier le microbiome humain (les microbes qui persistent dans le corps humain) a commencé avec identification par PCR des gènes ARNr 16S. Le séquençage aléatoire, dans laquelle l’ADN est extrait des tissus humains et du sang – une stratégie appelée métagénomique – sera bientôt suivi. Les méthodes actuelles d’amplification du génome entier peuvent détecter même les quantités infimes de l’ADN microbien présent dans une seule cellule [1 ▪]. Seule une fraction des microbes identifiés à ce jour ont été cultivées avec succès, et des milliers de microbes jusque-là inconnues restent à être caractérisés et nommés [2 ▪ ▪].
Cette explosion de nouvelles connaissances a été menée par des chercheurs travaillant avec le projet du NIH sur le microbiome humain (2008-2012) [3 ▪] et MetaHIT (2008-2012) [4]. Nous savons maintenant que les cellules microbiennes dans le corps humain sont plus nombreuses que les cellules humaines par au moins un facteur 10 [5]. En outre, de nombreuses espèces survivent par transfert horizontal de gènes et partage de fonctions communautaires [6 ▪]. En effet, les génomes bactériens qui ont été entièrement séquencés montrent autour de 5-45% de leurs gènes ont été acquis par ce transfert horizontal de gènes [2 ▪ ▪].
En Octobre 2012, la base de données en ligne contient 1965 génomes séparés, génomes bactériens entièrement remplis, avec 14 743 en cours (Fig. 1) [7 ▪]. Cependant, les virus et les bactériophages (constituant le virome humain), ainsi que les champignons, contribuent également à la microbiome humain. Fierté et al. [8] ont récemment montré que les bactériophages même dominent le virome de la cavité buccale.

Figure 1
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Ces microbes persistent non seulement sur les surfaces des muqueuses du corps, mais également dans des tissus tels que l’endomètre [9] et les poumons [10 ▪], ainsi que dans le sang [11]. Parce que les monocytes et les macrophages ont infectés le trafic de tous les tissus du système immunitaire, ils un impact sur plusieurs processus du corps. Par exemple, l’acétaminophène analgésique est métabolisé différemment en fonction de la présence ou de l’absence de métabolites spécifiques bactériens [12 ▪].

Les êtres humains sont des superorganismes

Les gènes du microbiote se comptent en millions, éclipsant les 20 500 qui composent le génome humain [13]. Les gènes de ces habitants microbiens interagissent souvent avec les nôtres que les êtres humains sont mieux décrits comme des «superorganismes» [14]. Une analyse a démontré que l’expression de 463 gènes humains est modifiée au cours d’une seule infection par Mycobacterium tuberculosis [15]. L’ampleur de l’interactome – ces interactions protéiques étrangères et d’accueil – commence à peine à être étudié. Sur la base de l’analyse du réseau de la maladie génétique humaine, l’enzyme de conversion de l’être humain (ACE) a été liée à l’infarctus du myocarde, la maladie d’Alzheimer, le diabète sucré, et la sarcoïdose [16]. Cependant, les microbes Lactobacillus and Bifidobacteria – communs dans les produits laitiers et considérée comme inoffensive – régulent en fait, négativement l’expression de l’ACE [17]. En modifiant l’expression de l’ACE, ces bactéries vont également affecter la progression de ces maladies inflammatoires de façon pas encore pleinement comprise ..

COMPOSITION MICROBIENNE EN SANTÉ ET EN MALADIE

Des différences significatives peuvent être trouvés dans les microbiomes des patients atteints de
maladies auto-immunes telles que le diabète type I [18] et II [19], la maladie de Crohn [20], la colite ulcéreuse, et le psoriasis [21]. Même la composition du protéome céphalo-rachidien est sensiblement modifiée dans la maladie auto-immune. Schutzer et al. [22 ▪ ▪] a constaté que si les individus sains et des patients atteints du syndrome de fatigue chronique (SFC) [23], abritait un grand nombre des mêmes protéines dans le liquide céphalo-rachidien, 738 de 2783 protéines détectées étaient uniques à des patients atteints de SFC . Parce que la plupart des protéines créées dans le corps de microbes, ces changements sont le reflet direct des modifications de l’interactome humain.
Au lieu de suivre la présence ou l’absence d’agents pathogènes isolés, ces études montrent une dysbiose de communautés entières de microbes chez les patients qui sont malades. Par conséquent, les postulats de Koch, qui exigent qu’un seul microbe doit provoquer une maladie unique, ne sont plus pertinentes dans l’ère du métagénome.
Cependant, une multitude d’autres facteurs environnementaux, en plus de la maladie peut entraîner des changements importants dans la composition du microbiome, ce qui rend les déplacements liés à la maladie plus difficile à cerner et étudier [24 ▪ ▪]. Le microbiome vaginal varie en fonction des règles [25 ▪]. La composition microbienne de l’avant-bras et des aisselles sont «écologiquement dissemblables comme les forêts tropicales le sont par rapport aux déserts» [26]. Ainsi, en plus de déterminer quelles espèces de pathogènes différents porte l’un, nous devons aussi examiner ce que les génomes de ces microbes font réellement dans le but de provoquer un dysfonctionnement et la maladie.

Nous devons nous concentrer sur les microbes intracellulaires.
De nombreux microbes réussissent à subvertir le système immunitaire de l’hôte et survivent à l’intérieur des cellules, en modifiant l’expression des gènes de l’homme et en modifiant les processus de réparation de transcription, la traduction et l’ADN [27].
Le pathogène qui induit une dérégulation de l’expression des gènes par le récepteur de la vitamine D nucléaire (VDR) fournit un excellent exemple de la façon dont ces interférences ne peuvent aboutir à la caractéristique de dysfonctionnement systémique de la maladie auto-immune. Le VDR contrôle l’expression d’au moins 1000 gènes [28]. Elle réglemente également les éléments clés de la réponse immunitaire innée, y compris les récepteurs Toll-like 2 (TLR2) avec la cathélicidine et les peptides antimicrobiens bêta-défensines (AMP), qui jouent tous un rôle central dans le ciblage des pathogènes intracellulaires [29].
Compte tenu de l’importance du VDR dans la réponse immunitaire innée de l’hôte, ces microbes capables de dérèglement d’expression par ce récepteur améliorent grandement leurs chances de survie. Le virus d’Epstein-Barr, qui a été associé à de nombreux diagnostics de maladies auto-immunes, ralentit l’expression du VDR dans des lignées cellulaires lymphoblastoïdes immatures par un facteur supérieur à 30 [30]. La borrelia burgdorferi [31], le cytomégalovirus [32], Mycobacterium leprae [33 ▪], et Mycobacterium tuberculosis [15] persistent en diminuant l’activité du récepteur à des degrés divers. L’aspergillus fumigatussecretes une gliotoxine qui atténue significativement l’expression par le VDR [34 ▪]. En effet, la dysrégulation du VDR est un mécanisme de survie logique que ces microbes bien caractérisés ne représentent probablement qu’une poignée de ceux qui résistent d’une manière similaire ou de la même manière.
La dysrégulation VDR est signalée par la hausse des niveaux de la vitamine D active métabolite 1,25-dihydroxy-D (1,25-D) [35]. Nos données in silico montrent que la 1,25-D peut interférer avec l’expression d’autres principaux récepteurs nucléaires, y compris le récepteur aux glucocorticoïdes, le récepteur des androgènes, et le récepteur de la thyroïde, provoquant une série de déséquilibres hormonaux [36,37]. En outre, ces récepteurs deviennent de plus en plus incapable d’exprimer les autres familles de SAP sous leur contrôle, conduisant à une suppression profonde du système immunitaire inné. En fait, la sarcoïdose [38] et la maladie de Crohn [39] sont caractérisées par une expression diminuée de cathélicidine au fil du temps.

INFECTIONS SUCCESSIVES

Les personnes souffrant de dérèglement des récepteurs VDR ou connexes deviennent de plus en plus immunodéprimés, l’acquisition de plus de pathogènes. Comme ces microbes régulent positivement ou négativement l’expression des gènes de l’homme, le microbiome déplace plus loin d’un état homéostatique, un processus que nous appelons l’infection successive. Les métabolites et les protéines produites par ces microbes interférent avec le métabolisme de l’hôte, conduisant à l’accumulation de protéines étrangères, les enzymes, les ARNm et des déchets de métabolites dans le cytoplasme. Par exemple, les humains et l’Escherichia coli métabolisent le glucose-6-phosphate de la même façon, la production de métabolites presque identiques [40]. Ainsi, les génomes des deux espèces qui échangent des nutriments et des toxines, la transcription et la traduction se compliquent pour les deux espèces. Ces interactions se produisent sur une vaste échelle. Considérant les codes du génome du VIH pour seulement 9 gènes, qui sont transcrits à partir de 19-21 protéines. Pourtant, 1434 interactions directes ont été identifiés entre seulement ces 19 protéines et le métabolome humain [41].
Eventuellement, plus il y a d’agents pathogènes incorporés dans le microbiome et les niveaux de dysbiose augmentent, les gens commencent à présenter des symptômes caractéristiques d’un diagnostic auto-immun ou inflammatoire. Les symptômes de la maladie notamment et les manifestations individuels dépendront de l’espèce, le lieu et la virulence des agents pathogènes qui s’accumulent au fil du temps, couplé avec les moyens semi-infinis dans lesquels les protéines de ces microbes provoquent un dysfonctionnement en interagissant avec les protéines de l’hôte [ 42].

MIMETISME MOLÉCULAIRE

L’homologie de séquence entre les structures des nombreuses protéines microbiennes, et les gènes qui les créent, font qu’il est difficile pour le corps de distinguer les «étrangers» du «soi» [43]. «Le mimétisme moléculaire» serait extrêmement fréquent. Kusalik et al. [44] ont trouvé que 19 605 pentamères de l’hépatite C (VHC) polyprotéine ont un niveau élevé de similitude avec le protéome humain. Cette similitude remarquable a persisté même lorsque l’équipe a utilisé des motifs plus peptidiques comme des sondes pour la numérisation d’identité. Krishnadev et Srinivasan [45 ▪] ont rapporté des dizaines de milliers d’interactions protéine-protéine entre les génomes de E. coli, Salmonella, Yersinia, et l’être humain. Trost et al. [46 ▪] ont découvert que des protéines créées par des agents pathogènes provoquant des infections chroniques ont une plus grande similitude avec le protéome humain que ceux créés par les microbes responsables d’infections aiguës. En effet, ces agents pathogènes capables de mieux désactiver le métabolisme de l’hôte devraient plus facilement persister.

COMORBIDITÉ

Les niveaux élevés de multimorbidité [47] chez les patients atteints de maladie auto-immune soulignent l’importance des infections successives. Il n’y a jamais deux personnes qui acquérisent exactement la même composition de microbes et donc développeront la maladie d’une présentation identique. La figure 2 montre le niveau très élevé de chevauchement entre les diagnostics. Ce chevauchement signifie que les différents diagnostics inflammatoires seraient mieux étudiés si traités de concert. Par exemple, l’obésité est dit pour provoquer le diabète, mais les deux conditions sont désormais liée à la dysbiose microbienne [2 ▪ ▪]. Il est plus probable que les deux maladies résultent de l’infection successive, une pathogénie commune sous-jacente.

Figure 2
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AUTOANTICORPS

Le mimétisme moléculaire contribue également à la production d’auto-anticorps. Comme les anticorps humains sont polyspécifiques, certains anticorps créés pour cibler les agents pathogènes souvent ciblent des protéines de l’homme, provoquant des «dommages collatéraux» [48]. En effet, un nombre croissant d’ «autoanticorps», y compris le facteur rhumatoïde, anticorps antiphospholipides, anticorps anti-Saccharomyces cerevisiae (ASCA), et les anticorps antinucléaires (ANA) sont créées en réponse aux agents infectieux [49].

REGROUPEMENT FAMILIAL

Des grappes de maladie existent souvent au sein des familles, ce qui suggère une cause commune. Dans les familles qui ont un membre qui souffre du syndrome de Sjögren primaire, 38% avaient au moins un parent atteint au premier degré d’une maladie auto-immune contre 22% dans les familles de contrôle [50]. Les époux ont des taux beaucoup plus élevés de sarcoïdose [51]. Expliquer ces associations, demanderait des variantes génétiques à haut risque [52]. Pourtant, ce n’est pas viable d’un point de vue évolutif, que ces variantes du gène confèrent aucun avantage de survie connue et aurait dû être éliminés de la population. Au contraire, la prévalence de presque toutes les maladies auto-immunes est à la hausse.
Il y a des preuves croissantes que les maladies auto-immunes fonctionnent dans les familles en raison du partage des microbes communs [53 ▪ ▪]. Par exemple, frères et sœurs, des mères infectées, et les pères sont les principales sources d’acquisition d’Helicobacter pylori chez les jeunes enfants, avec la mère infectée qui sert de principale source indépendante [54]. Le microbiome d’un enfant se développe et est le reflet direct de ceux hébergés par la mère et les proches parents. Les microbes sont introduits par une multitude de sources, y compris le placenta, le sperme, les oeufs, le lait maternel, et le canal vaginal [37].

REPENSER LE POLYMORPHISME DE SIMPLES NUCLEOTIDES : IL N’Y A PAS DES MILLIONS DE MALADIES DISTINCTS

La preuve de l’infection successive sape la primauté du rôle du génome humain dans la maladie. Pendant l’euphorie qui a résulté dU décodage du génome humain, les scientifiques ont peint un avenir où la maladie serait bientôt prédite, diagnostiquée et traitée uniquement en se fondant sur l’analyse du génome d’un patient. De nombreux scientifiques s’attendaient à trouver un gène associé à chaque maladie. Cependant, 10 ans plus tard, nous avons un catalogue de 10 millions de polymorphismes de nucléotides simples (SNP) [55,56]. Pourtant, même cette complexité ahurissante a omis de remettre toute compréhension significative des thérapies ou de maladie chronique. Récemment, l’accent s’est déplacé vers la génétique pour identifier les groupes de SNP associés à chaque diagnostic, mais même cela n’a pas encore porté ses fruits.
Qu’est-ce que l’on mesure? La science génétique n’a pas encore remarqué l’éléphant dans la pièce – l’ADN et de l’ARN microbienne qui se dégage sur le microbiome humain à partir de cellules infectées. Ceci contamine les échantillons d »ADN humain en cours d’analyse.
Merriman [57] a écrit un assembleur génomique qui ne deviendrait pas confus en présence des innombrables ARN microbiens contaminants des échantillons humains. Ce qu’il a trouvé était étonnant – le logiciel commercial qui est au cœur de la recherche génétique d’aujourd’hui est extrêmement sensible aux échantillons qui ne correspondent pas tout à fait exactement dans la carte du génome humain. Même la plus petite quantité d’ARN microbienne contaminée – juste une ou deux paires de bases écart »- a suffi à provoquer des erreurs très importantes. Ainsi, bon nombre de ces 10 millions de SNP, peut-être la majorité d’entre eux, peut-être dû à une erreur de logiciel.
Le groupe Edwards à l’Argonne National Labs [58 ▪ ▪] a développé des algorithmes sophistiqués capables de déterminer et d’éliminer l’ARN non-humains d’une étude d’association pangénomique (GWAS)de l’échantillon avant assemblage. Malheureusement, peu de chercheurs utilisent cet outil, même si les algorithmes fournissent également une liste d’espèces microbiennes détectées dans l’échantillon.

IMMUNOSTIMULATION COMME UNE NOUVELLE AVENUE THÉRAPEUTIQUE

Si la dysbiose du microbiome conduit à la maladie auto-immune, alors les traitements qui ciblent la cause de ces conditions doit chercher à stimuler plutôt que de supprimer les défenses immunitaires [59 ▪ ▪]. Au cours de la dernière décennie, nous avons testé une thérapie pour la maladie auto-immune qui paraît fortement activer la réponse immunitaire innée. Le traitement repose sur l’utilisation d’un agoniste VDR putatif olmésartan, qui, en réactivant le récepteur, apparaît rétablir progressivement l’expression des défenses immunitaires innées sous son contrôle [59 ▪ ▪]. Les médecins ont noté une amélioration conséquente symptomatique dans un environnement clinique, mais il reste à voir si cela peut être reproduit dans un essai contrôlé randomisé.
Nos collègues cliniciens ont noté que le primordial pour le succès de ce traitement est la capacité des patients à gérer l’immunopathologie, la réponse du système immunitaire à la mort microbienne. Comme les agents pathogènes sont ciblés, le système immunitaire de l’hôte libère des cytokines et des chimiokines afin de tuer les agents infectieux. En outre, l’organisme doit composer avec les sous-produits de microbes et les cellules mortes, qui le peuplaient autrefois. En conséquence, les symptômes des patients s’aggravent avant de finalement disparaître. L’immunopathologie n’est pas propre à cette thérapie, il s’agit plutôt d’une conséquence nécessaire de la réponse immunitaire à la mort microbienne, qui a été bien documentée [37]. . Par exemple, Wang et al [60 ▪] ont montré que les souris conçues pour avoir une réduction de la réponse immunitaire innée pour le rhume ont effectivement montré moins – pas plus – d’inflammation des voies respiratoires et de broncho-constriction après l’infection. Ainsi, les symptômes causées par le froid ont été causés par la réponse immunitaire de l’organisme au virus, plutôt que le virus lui-même.
La norme de soins pour les maladies auto-immunes est l’immunosuppression. Les médicaments immunosuppresseurs générent un soulagement des symptômes de courte durée, souvent en ralentissant l’immunopathologie. Cependant, la rechute et la gravité accrue de la maladie sont fréquents chez les patients recevant ces médicaments, puisque sur le long terme, ils permettent les pathogènes qui permettent aux processus auto-immuns de se propager plus facilement.
La flambée mondiale des maladies auto-immunes laisse présager une crise sanitaire imminente. En utilisant ces médicaments immunosuppresseurs, nous ne visons pas la cause de ces maladies et nous ne faisant qu’exacerber la prolifération des agents pathogènes. Les traitements immuno-stimulateurs peuvent être administrés dès les premiers signes de la maladie, et assurent un minimum la prolifération et une immunopathologie minimale d’agents pathogènes. Cependant, la capacité de réussite des immuno thérapies dépend de la volonté des comités institutionnels d’accepter le phénomène de l’immunopathologie, l’aggravation initiale des symptômes, afin d’assurer un meilleur pronostic à long terme pour le patient et pour la communauté dans son ensemble.

CONCLUSION

Au cours de la dernière décennie, de nouvelles technologies de séquençage qui caractérisent les microbes sur la base de leur ADN ont révolutionné le domaine de la microbiologie. Nous savons maintenant que le corps humain abrite un vaste microbiome, dont la composition contribue directement à des processus auto-immuns. Les pathogènes intracellulaires provoquent des dérèglements systémiques en modifiant directement la transcription des gènes et des mécanismes de traduction. Le dérèglement du récepteur VDR nucléaire par de tels agents pathogènes diminue successivement les défenses immunitaires innées, permettant aux individus compromis de cette façon d’accumuler un microbiote pathogènes distincts. Au fil du temps, cela peut conduire à l’élaboration d’un ensemble unique de symptômes se présentant comme un ou plusieurs diagnostics auto-immuns. Le mimétisme moléculaire entre les métabolites et les pathogènes de l’hôte contribue en outre à un dysfonctionnement via l’interactome. Les maladies auto-immunes sont plus susceptibles d’être présentes chez les familles en raison de l’héritage du microbiome familial plus que l’héritage des anomalies génétiques mendéliennes. En lieu et place de l’immunosuppression, les thérapies qui traitent les maladies auto-immunes doivent viser à stimuler l’immunité innée afin de permettre le ciblage des agents pathogènes qui sous-tendent le processus de la maladie.

Conflits d’intérêts
Aucun conflit d’intérêts.

Références et ouvrages recommandés
Documents d’intérêt particulier, publiées dans la période annuelle d’examen, ont mis en évidence que:
▪ d’un intérêt particulier
▪ ▪ un intérêt exceptionnel
Autres références relatives à ce sujet peuvent également être trouvés dans la section littérature mondiale actuelle dans ce numéro (p. 278-279).

RÉFÉRENCES

1 ▪. Lasken RS. Séquençage du génome de micro-organismes non cultivés à partir des cellules individuelles. Nat Rev Microbiol 2012; 10:631-640.
Un examen de la seule cellule d’échantillonnage, une approche puissante et prometteuse pour comprendre le rôle des microbes intracellulaires dans les maladies chroniques.

▪ ▪ 2. Pflughoeft KJ, Versalovic J. microbiome humain en matière de santé et de maladie. Annu Rev Pathol 2012; 7:99-122.
Cette étude fournit une vue d’ensemble forte des différences dans les populations microbiennes chez les patients atteints de plusieurs affections inflammatoires par rapport aux témoins sains.

3 ▪. Human Project Consortium microbiome.
Structure, la fonction et la diversité du microbiome humain en bonne santé. Nature 2012; 486:207-214.
Une étude réalisée par le consortium du projet sur le microbiome humain caractériser les microbes associés à l’homme sain.

4. J Qin, Li R, Raes J, et al. Un catalogue microbienne intestinale humaine gène établi par séquençage métagénomique. Nature 2010; 464:59-65.

5. Turnbaugh PJ, Ley RE, Hamady M, et al. Le projet sur le microbiome humain. Nature 2007; 449:804-810.

6 ▪. Smillie CS, Smith MB, Friedman J, et al. Ecologie conduit un réseau mondial d’échange de gènes reliant le microbiome humain. Nature 2011; 480:241-244.
Transfert horizontal de gènes est une stratégie microbienne généralisée et importante pour le succès de reproduction.

7 ▪. Pagani I, Liolios K, J Jansson et al. Les génomes de base de données en ligne (GOLD) v.4: état des projets de génomique et métagénomique et leurs métadonnées associées. Nucleic Acids Res 2012; 40: D571-D579.
Une ressource complète pour la surveillance continue des projets complets et métagénome.

8.Fierté DT, Salzman J, M Haynes et al.
Preuve d’une population résidente bactériophage robuste révélé par l’analyse du virome salivaire humain. ISME J 2012; 6:915-926.

9.DiGiulio DB, Romero R, Amogan HP, et al.
Prévalence microbienne, de la diversité et de l’abondance dans le liquide amniotique pendant le travail prématuré: une enquête moléculaire et fondée sur la culture. PLoS One 2008; 3: e3056.

10 ▪. DN Cornfield Blainey PC, Milla CE,, SR Quake.
L’analyse quantitative de l’écologie microbienne des voies respiratoires de l’homme révèle une signature omniprésente de la fibrose kystique. Trad Sci Med 2012; 4:153 RA30.

Bien que l’on croyait être stérile, voire des poumons sains abritent un microbiome prolifique. Étude avenir promet un aperçu de maladies respiratoires chroniques.

11.Moriyama K, C Ando, ​​Tashiro K, et al.
Détection de réaction de polymérisation en chaîne de l’ARNr 16S gène dans le sang humain. Microbiol Immunol 2008; 52:375-382.

12 ▪. Loo RL, Chan Q, Brown IJ, et al. Une comparaison de l’auto-évaluation de l’utilisation d’analgésiques et la détection de l’ibuprofène et ses métabolites urinaires acétaminophène à l’aide d’métabonomique: l’Étude INTERMAP. Am J Epidemiol 2012; 175:348-358.
Cette étude montre qu’un médicament couramment utilisé est métabolisé différemment en fonction de la présence ou de l’absence de certains métabolites bactériens.

13. Pince M, B Fry, Kamal M, et al. Distinguer les gènes codant pour des protéines et non codante dans le génome humain. Proc Natl Acad Sci US A 2007; 104:19428-19433.

14. Goodacre R. métabolomique d’un super-organisme. J Nutr 2007; 137: S259-S266.

15. Xu Y, J Xie, Li Y, et al. À l’aide d’un microréseau d’ADNc pour étudier l’expression du gène cellulaire altérée par Mycobacterium tuberculosis. Chin Med J 2003; 116:1070-1073.

16. Goh KI, Cusick ME, Val D, et al. Le réseau des maladies humaines. Proc Natl Acad Sci US A 2007; 104:8685-8690.

17. Ramchandran L, Shah NP. Profils protéolytiques et l’angiotensine-I l’enzyme de conversion et des activités inhibitrices de l’alpha-glucosidase de bactéries lactiques sélectionnées. J Food Sci 2008; 73: M75-M81.

18. Giongo A, KA Gano, Crabb DB, et al. Vers la définition du microbiome auto-immune, diabète de type 1. ISME J 2010; 5:82-91.

19. Larsen N, Vogensen FK, FW van den Berg et al. Microbiote intestinal chez les adultes humains diabétiques de type 2 se distingue des adultes non diabétiques. PLoS One 2010; 5: e9085.

20. Morgan XC, Tickle TL, Sokol H, et al. Dysfonction du microbiome intestinal dans la maladie inflammatoire de l’intestin et de traitement. Génome Biol 2012; 13: R79.

21. Gao Z, Tseng CH, BE Strober, et al. Des modifications substantielles du biote cutanée bactérienne dans les lésions psoriasiques. PLoS One 2008; 3: e2719.

▪ ▪ 22. Schutzer SE, Angel TE, Liu T, et al. Distinctes protéomes liquide céphalo-rachidien post-traitement de différencier la maladie de lyme du syndrome de fatigue chronique. PLoS One 2011; 6: e17287.
Cette étude montre différences uniques dans les protéomes associés aux maladies inflammatoires deux par rapport à l’autre et à des témoins sains ..

Source : The human microbiome and autoimmunity

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